Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms