Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgaeQ60677 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms