Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xrcc1Q60596 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms