Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema5bQ60519 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms