Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc125Q5U465 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc125Q5U465 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms