Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms