Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm12253Q5NC48 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm12253Q5NC48 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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