Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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