Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ecm2Q5FW85 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms