Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms