Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syne3Q4FZC9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms