Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt35Q497I4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms