Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ulk4Q3V129 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms