Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Dnah12Q3V0Q1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Dnah12Q3V0Q1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Dnah12Q3V0Q1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Dnah12Q3V0Q1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Dnah12Q3V0Q1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Dnah12Q3V0Q1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms