Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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