Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd53Q3V0J4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms