Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garnl3Q3V0G7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms