Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms