Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UZV7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UZV7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UZV7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms