Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm20Q3UQS8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm20Q3UQS8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm20Q3UQS8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm20Q3UQS8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm20Q3UQS8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm20Q3UQS8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm20Q3UQS8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms