Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem253Q3UNB8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms