Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edc4Q3UJB9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Edc4Q3UJB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms