Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms