Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms