Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Puf60Q3UEB3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Puf60Q3UEB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms