Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms