Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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Gtpbp6Q3U6U5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Gtpbp6Q3U6U5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms