Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms