Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3TTL0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms