Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms