Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms