Protein–RNA interactions for Protein: Q32M08

Dus4l, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+]-like, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dus4lQ32M08 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dus4lQ32M08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dus4lQ32M08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms