Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl9Q32KG4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl9Q32KG4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms