Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
1700061G19RikQ08EE8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms