Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gata4Q08369 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms