Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms