Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LyarQ08288 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LyarQ08288 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LyarQ08288 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms