Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdx4Q07424 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms