Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cntn3Q07409 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms