Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CluQ06890 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CluQ06890 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CluQ06890 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CluQ06890 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CluQ06890 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CluQ06890 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CluQ06890 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CluQ06890 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CluQ06890 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CluQ06890 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CluQ06890 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CluQ06890 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CluQ06890 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CluQ06890 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CluQ06890 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CluQ06890 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CluQ06890 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CluQ06890 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CluQ06890 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CluQ06890 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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CluQ06890 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CluQ06890 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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