Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39Q06138 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms