Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPINDOCQ05AH6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPINDOCQ05AH6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms