Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcst1Q059Y8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 344.1 ms