Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc2Q05020 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms