Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelaQ04207 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RelaQ04207 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms