Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms