Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax5Q02650 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms