Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp39Q02525 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp39Q02525 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms