Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms