Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp1Q01514 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms